Блог

PsychoPy теперь онлайн

Начиная с версии 1.85.0 у пользователей PsychoPy теперь есть возможность экспортировать свой эксперимент как web-страницу. Загрузив ее на свой сервер, вы сможете собирать данные онлайн (http://www.psychopy.org/online/online.html).

Как это работает: PsychoPy использует для онлайн-версий экспериментов JavaScript и WebGL. Современные браузеры и компьютере в массе уже давно достаточно мощны для целей большинства исследователей. В сравнении с компьютерными играми, предъявление стимулов и запись времен реакции — до ужаса примитивная задача. Небольшая проблема в том, что исследователю обычно требует точно контроллировать время предъявления стимула и знать точное время реакции. С временем реакции все просто: здесь погрешность записи ничтожна в сравнении с разбросом данных конкретного испытуемого. Скриптовый язык JavaScript давно позволяет собирать данные об ответах испытуемого не хуже, чем это обычно делается оффлайн. С предъявлением чуть сложнее, и именно поэтому есть большие надежды, что использование WebGL позволит убрать последние преграды для онлайн исследований. WebGL задействует ресурсы видеокарты компьютера, что позволяет предъявлять стимулы быстро и синхронизировать их предъявление с частотой обновления экрана — и то, и другое критично для времени предъявления.

PsychoPy не единственное ПО, которое позволяет делать онлайн исследования. В последние годы в этом направлении появляется все больше проектов, например, хорошие отзывы получает jsPsych (http://www.jspsych.org/). Однако в отличие от других библиотек, у PsychoPy уже есть хорошая репутация и большая база пользователей. Возможно, теперь онлайн-эксперименты станут заметно более популярны, что, благодаря большим выборкам, приведет к резкому скачку в уровне надежности собираемых данных.

psychopy-course

Галерея работ первого конкурса Berlyne

В прошлом году мы проводили конкурс Berlyne (http://thinkcognitive.org/ru/berlyne), основной задачей которого было попробовать показать «эстетическую сторону исследований» или просто сделать что-то симпатичное, связанное с тематикой нашего сообщества. Опыт вышел удачным, и мы собираемся повторить его в этом году. А чтобы у участников конкурса было на что ориентироваться, вот галерея из некоторых работ так или иначе привлекших наше внимание. Они очень разные =)

Кроме того, мы обновили дизайн сайта — если вы заметите какие-то ошибки, напишите нам, пожалуйста, мы постараемся их исправить.

Хакатон по нейронаукам

Яндекс и факультет компьютерных наук НИУ ВШЭ устраивают хакатон по нейронаукам. Мероприятие пройдёт в московском офисе Яндекса в рамках проекта Data & Science.

Задачи будут сложные, интересные и, главное, совершенно реальные — в решениях заинтересованы центр нейроэкономики и когнитивных исследований НИУ ВШЭ и лаборатория управления сложными системами Института проблем машиноведения. Алгоритм победителя хакатона будет пущен в дело сразу после завершения соревнования. Призёры хакатона получат подарки.

Участие бесплатно, но необходимо зарегистрироваться. С собой нужно будет взять ноутбук со всеми необходимыми программами для анализа данных.

Детали и регистрация здесь: events.yandex.ru/events/ds/3−4-dec-2016/

TCTS ищет волонтера

Как знают многие читатели блога, весной мы запустили Telegram-чат TCTS.

В нем мы публикуем полезные ссылки, обсуждаем новости и общаемся на отвлеченные темы. Поначалу мы успевали собирать все упомянутое в чате в большой пост-дайджест и публиковать его в блоге (например, тут), но в последние месяцы времени стало катастрофически не хватать (даже на сам блог, да).

В связи с этим мы ищем волонтера или волонтерку для отслеживания и систематизации ссылок и дискуссий в чате. Единственная обязанность — раз в два-три месяца публиковать список полезных материалов и новостей с кратким их описанием. Человеку обязательно нужно:

  • свободно читать по-английски (или иметь достаточно времени чтобы просматривать большое количество материалов в своем темпе)
  • любить раскладывать информацию по темам (и делать это хорошо)
  • интересоваться когнитивной наукой.

Для начала нужно будет разгрести архив за последние 6 месяцев (около 60 ссылок в месяц), дальше — по желанию. В общем, если вы любите читать и хотите помочь нашему сообществу, напишите нам на

Data & Science: нейронауки

Коллеги, в Яндексе проходит серия конференций «Data & Science», посвящённых анализу данных в фундаментальных и прикладных науках. На второй конференции, которая состоится 29 октября, речь пойдёт о нейронауках. Докладчики расскажут про неинвазивные методы исследования мозга, что нужно для систем управления курсором с помощью взгляда и как датасаентисты могут помочь в диагностике эпилепсии.

На конференцию приглашаются специалисты в области анализа данных, нейрофизиологи, психологи-когнитивисты.

Программа мероприятия и форма для регистрации по ссылке ниже. Также предполагается видеотрансляция.

events.yandex.ru/events/ds/29-oct-2016/

***

В организации мероприятия принял участие один из наших со-основателей, Филипп Управителев

СССР возвращается

СССР возвращается! И нет, это мы не про итоги выборов и не про создание министерства государственной безопасности.

Это про конференцию СССР (Communication, Computation, and Cognitive Processes), которая в третий раз проводится ВШЭ в Москве (https://www.hse.ru/cdm-centre/announcements/182 684 998.html). В этот раз она будет с 28 по 29 сентября, в рамках программы конференции — масса интересных докладов российских и зарубежных ученых на тему внимания, памяти, принятия решений, как на уровне поведения, на и на уровне нейрофизиологии. Пожалуй, это одно из немногих стоящих когнитивных мероприятий в России, так что не пропустите. Обратите внимание — для участия требуется регистрация, подробности и программа конференции на сайте по ссылке выше.

картинка отсюда: http://mundienasmeargleartdesings.blogspot.com/2012/10/the-beatles-back-in-ussr-cd-cover.html

Результаты конкурса «Лучший постер школы по версии TCTS 2016»

В этом году мы вот уже в третий раз проводим конкурс на лучший постер среди участников летней школы «Теоретические и прикладные проблемы когнитивной психологии».

Мы оцениваем, в первую очередь, качество самого постера — т. е. подачу материала и качество оформления, оставляя за скобками содержание. Мы уже выкладывали список типичных ошибок, разбирая постеры прошлого года (http://thinkcognitive.org/ru/blog/rezul-taty-konkursa-luchshij-poster-shkoly-po-versii-tcts-2015#.V82mmK2TKrh_), и не будем останавливаться на их подробно. Поскольку состав участников школы меняется год от года, неудивительно, что ошибки в этом году примерно те же. Хотелось бы лишь кратко упомянуть три новых явления, с которыми мы столкнулись: градиенты, тени, и рельефные заголовки. Будем кратки — пожалуйста, не используйте такого рода эффекты в своих постерах.

Теперь о победителях. Из трех наиболее понравившихся нам постеров, победителем в итоге была выбрана Яна Паникратова с постером «Использование фМРТ покоя для индивидуального картирования областей мозга, связанных с регуляторными функциями». Ее постер представляет собой достаточно хорошее сочетание грамотного представления содержания и приятного оформления. Два других претендента на победу — постеры Владислава Хвостова и Юрия Маркова оказались тоже достаточно удачными, так что выбор был труден. Мы поздравляем Яну и желаем всем участникам конкурса стремиться к совершенству в работе над представлением результатов своих исследований! Ну и передавать свои знания по наследству следующим поколениям студентов.

Онлайн-программа «Анализ данных» от СПб АИ и Института биоинформатики

Дружеского пиара пост — на степике открывается программа переподготовки по анализу данных:

В октябре этого года Санкт-Петербургский Академический университет и Институт биоинформатики открывают новую онлайн-программу профессиональной переподготовки «Анализ данных» на stepic.org. Программа позволяет овладеть навыками анализа данных, необходимыми для проведения исследований, и будет полезна любому начинающему учёному, или просто человеку, интересующемуся Data Science. Программа не требует глубоких знаний по математике или статистике и проходить ее может любой желающий. На данный момент предполагается две образовательных траектории — Data Science и Data Engeneering. На мой взгляд, психологам вполне подошел бы первый трек — если не для работы, то хотя бы для общего развития.

Узнать подробности и подписаться на новости о программе можно на http://data.stepic.org.

Когнитивные тренировки возвращаются

Интересные новости из мира когнитивных тренировок.

Пока не опубликованные данные лонгитюдного исследования ACTIVE (Advanced Cognitive Training for Independent and Vital Elderly, n=2785) показывают, что компьютерные тренировки, направленные на увеличение «скорости обработки информации», могут снижать риск развития деменции в будущем. В исследовании было 4 группы пожилых участников. Одна группа в течение 10 часов занималась по протоколу speed processing, две другие получали те же 10 часов занятий на тему «как улучшить память"/"как улучшить логическое мышление», а четвертая не делала ни того, ни другого. Через 5 лет половина участников экспериментальных групп прошли дополнительные тренировки, но различий по вероятности деменции между группами не было. Еще через 5 лет они обнаружились. Среди контрольной группы критериям деменции соответствовали 14%, а среди группы speed processing -- 8%. Более того, участники, получавшие дополнительные тренировки на 5летней отметке, показали еще меньший риск, что говорит о накопительном эффекте тренировок.

Автор исследования Джерри Эдвардс занимается разработкой своего протокола уже давно, и даже успела за время лонгитюда продать права на этот тип тренировок. Пример одного из типов проб показан на слайде -- задача участника обнаружить и запомнить объекты, предъявленные на очень короткое время, и причем это время предъявления адаптивно снижается. Ранее команда уже опубликовала данные о том, что тренировки speed processing помогают людям в возрасте лучше водить машину и выполнять еще ряд повседневных задач. Конечно, заявка на снижение риска деменции -- это гораздо более серьезный шаг.

Это первые масштабные данные такого рода, и они идут в разрез с распространенным на данный момент мнением о силе когнитивных тренировок (вернее, ее отсутствии). В прошлогоднем открытом письме от Стэндфордского Center on Longevity этому посвящено отдельное предложение: «No studies have demonstrated that playing brain games cures or prevents Alzheimer’s disease or other forms of dementia». Противники письма настаивали тогда на том, что исследований нет ПОКА. Сейчас этот переломный момент вполне может наступить, если исследование пройдет рецензирование в том виде, в котором оно было представлено на конференции Alzheimer’s Association.

Однако уже сейчас можно отметить некоторые слабые места картины. Самое бросающееся в глаза -- это соотношение длительности тренировок и их эффекта. Каким образом результат от 10 часов активности проявляется через 10 лет? Одна из версий авторов заключается в том, что раз тренировка снижает риск аварий на дорогах, то испытуемые этой группы продолжали дольше водить машину, тем самым тренируя скорость восприятия и в обычной жизни. Кроме того, неизвестно, что именно тренирует speed processing, и чем на уровне механизма воздействия этот протокол отличается от других, а также почему разница появилась именно между 5 и 10 годами после начала исследования.

За этой историей будет интересно следить дальше. Пока что область когнитивных тренировок это поле боя между коммерческими проектами типа Lumosity (оштрафованных за не подтвержденные научно рекламные обещания), и двумя группами исследователей: полными скептиками и теми, кто верит в специфический эффект каких-то специальных видов тренировок. Сейчас ход за последними.

Бродман умер, да здравствует Бродман

Эта неделя ознаменовалась выходом нового детального атласа коры головного мозга человека, основанного на данных Human Connectome Project.

Можно долго спорить о том, ведет ли все более подробная детализация к лучшему пониманию собственно работы мозга (spoiler alert -- по большому счету, не ведет), но уточнение карт -- это несомненно большой шаг в сторону более прицельных гипотез и осмысленных выводов из когнитивных нейронаучных исследований, не говоря уже о более прикладном использовании, например, в нейрохирургии.
Карта, созданная под руководством Мэтью Глассера и Дэвида ван Эссена, основана на комбинации структурных и функциональных снимков мозга 210 испытуемых, и проверена на еще 210. В анализе использовался новый алгоритм выравнивания (alignment) индивидуальных изображений и полуавтоматизированный алгоритм разделения коры по границам, присутствующим в более чем одной метрике (например, миелинизация + фМРТ состояния покоя). В результате каждое полушарие оказалось разделено на 180 зон.

Широкое обсуждение этих данных также возбудило интерес к другому атласу, опубликованному этой весной китайским проектом Brainnetome (не самое лучшее название, но работа очень интересная). В отличие от Глассера и коллег, команда Лижона Фанга создала карту на основе диффузионной МРТ (техники, измеряющей геометрическое строение пучков нервных волокон) и алгоритмов вероятностной трактографии. На их карте коры получилось 210 зон, часть из которых совпадает с картой Глассера, но часть -- особенно во фронтальной коре -- представляют более мелкое деление. Теперь, безусловно, интересно, что получится, если совместить данные фМРТ и данные трактографии в одной модели (если такие совмещенные данные существуют).

Конечно, с улучшением качества данных и алгоритмов анализа число стабильно и достоверно выделяемых зон коры будет возрастать. Осталось только понять, что в них происходит;)

А для тех, кто хочет попробовать разделить усредненный мозг на новые зоны в среде FreeSurfer, есть инструкция здесь