Блог

Спецвыпуск Phil Trans B о регуляции мозговой активности

Журнал Philosophical Transactions выпустил тематический номер с красивым названием «Регуляция активности мозга для изменения восприятия, поведения и общества».

Выпуск в основном состоит из обзоров, показывающих возможности, достижения и проблемы различных техник нейростимуляции и контроля мозговой активности. Обсуждаются как клинические, так и фундаментальные исследования, на разных уровнях (клетки, ансамбли и т. д.) и в разных организмах. Получился отличный срез современного состояния темы, must read для тех, кто интересуется возможностями и будущим нейрорегуляции. Часть статей находится в открытом доступе.

Читать на сайте журнала: rstb.royalsocietypublishing.org/content/370/1677

МРТ в 3D

Подробная инструкция по созданию объемных визуализаций данных МРТ от Криса Мадана (Boston College) опубликована на ресурсе F1000 Research.

Инструкция основана на свободно распространяемых программах ITK-SNAP и ParaView, но для первичной обработки данных также понадобится стандартная фМРТ-среда типа SPM, FSN или NiFTI. Конечно, объемные визуализации в целом передают меньше информации, чем 2D-срезы, и и х сложнее интерпретировать, но в некоторых случаях они могут помочь показать общую картину активаций, в дополнение к классическим изображениям.

Ссылка на статью: f1000research.com/articles/4−466/v1

Ну, а если #горячаяюнаякогнитивная душа требует нейропраздника с подарками, объемную модель мозга (структурную, для начала) можно напечатать на 3D-принтере и всегда носить с собой. Довольно короткий путь описан здесь vincentadam87.wordpress.com/2014/12/21/3d-print-your-own-brain/, но по сети бродит еще несколько описаний процесса, на любой вкус и софт.

Всем доступных визуализаций!

Сайту «Software for visual psychophysics» исполнился 21 год

Сайту «Software for visual psychophysics» исполнился 21 год! Мы уже упоминали про этот замечательный ресурс, но в честь такой знаменательной даты можно сказать про него еще раз. На этом сайте с 1994 года собирается информация о самом разном ПО для проведения экспериментов, анализа данных, работы со специфическими устройствами, и всем прочем, что может понадобиться занимающимся исследованиями в области зрения. Несмотря на название, ПО сайт не ограничивается — там также есть множество полезных ссылок на обучающие материалы, всякие демо перцептивных эффектов, листы рассылки, и т. п. Полезнейшая для начинающих исследователей вещь, короче: http://www.visionscience.com/documents/strasburger/strasburger.html.

Первая статья проекта MyConnectome

Прошлая неделя выдалась продуктивной для исследователей коннектома человека. Во-первых, в Neuron вышла удивительная статья от группы Рассела Полдрака по результатам проекта MyConnectome (http://myconnectome.org/).
На протяжении 76 недель (!), три раза в неделю (!) сам Рассел Полдрак проводил время в сканере, собирая данные о своем мозге (фМРТ с классическими задачами и в состоянии покоя). В результате в распоряжении исследователей оказалось огромное количество данных об одном-единственном мозге. С помощью этих бесценных данных стало возможным в том числе проанализировать, насколько парцелляция на основе состояния покоя соответствует активациям, полученным у того же испытуемого при выполнении задаы, а также проверить, насколько стабильны результаты от сессии к сессии у одного и того же испытуемого. Подробнее об исследовании можно прочесть в статье, или посмотреть в замечательном видео-абстракте, но основные результаты показали, что в целом возможно восстановить стабильную и подробную картину функциональной структуры индивидуального мозга, и эта картина в чем-то будет отличаться от групповой (почему -- отдельный вопрос), но для составления такого «портрета» необходимо гораздо больше данных, чем принято записывать в классических фМРТ-парадигмах. Кроме того, отмечено, что источники изменчивости в данных различаются при внутрииндивидуальном и межиндивидуальном анализе.

Ссылка на статью (и видео-абстракт!): T. Laumann et al. (2015) Functional System and Areal Organization of a Highly Sampled Individual Human Brain.
http://www.cell.com/neuron/abstract/S0896−6273(15)00600−5

И десерт. Вышел совершенно чудесный тулбокс для анализа связей мозга (connectivity). Он называется Multimodal Imaging Brain Connectivity Analysis toolbox (MIBCA) и позволяет проводить анализ мультимодальных данных в одной среде от начала и до конца, что раньше было практически невозможно. Тулбокс и подробности можно найти здесь: www.mibca.com/, а статью с описанием методов -- здесь: peerj.com/articles/1078/

Приятных вам связей, #горячиеюныекогнитивные!

Donders Discussion 2015

Ежегодная аспирантская конференция по нейронауке Donders Discussions, организуемая Donders Institute of Brain, Cognition and Behaviour будет проходить 5−6 Ноября в Наймегене, Голландия.

Конференция создана с целью дать возможность пообщаться аспирантам, занимающимся всеми разделами нейронауки в разных странах. В этом году в программе конференции впервые помимо постеров будут устные доклады. Особое внимание в программе будет уделено темам «Восприятие пространства и времени» и «Действия и когнитивный контроль».

Заявки на выступления с докладом принимаются уже сейчас, для подачи заявки нужно отправить тезисы (200 слов) на адрес dondersdiscussions [ at ] donders.ru.nl Авторам выбранных докладов оплатят дорогу и проживание.
Регистрация участников с постерными докладами будет проходить чуть позже, TCTS обещает следить за развитием событий.

Вакансия в лаборатории психогенетики ПИ РАО

Если кто из недавних выпускников в Москве ищет работу по специальности, возможно это неплохой вариант. Базовая ставка мл.н.с. — 20−25 тысяч, про объем доплаты из грантов обещают рассказать на собеседовании.

Лаборатория возрастной психогенетики и Российско-Британской лаборатории психогенетики Психологического института РАО объявляет конкурс на должность младшего научного сотрудника в генетически информативный психофизиологический проект связанный с изучением математической тревожности (исследование ЭЭГ и ВП у близнецов). Данный проект реализуется международным коллективом исследователей из Психологического института РАО, Международного центра изучения развития человека Томского государственного университета, Голдсмитс Университета Лондона, Университета Огайо и Королевского колледжа Лондона. Основная тема исследований лаборатории — изучение роли наследственных и средовых факторов в индивидуальных различиях психологических и психофизиологических фенотипов человека. Сотрудники имеют возможность активно участвовать в международных конференциях и школах, а также в грантах лаборатории.

Требования к кандидату:
Высшее образование, опыт работы с ЭЭГ, знание английского. Навыки программирования (R, Python, etc.) приветствуются.
CV и мотивационное письмо присылайте на почту .

Магистратура по нейробиологии в МГГУ

Нас попросили разместить информацию про еще одну магистратуру по нейробиологии. Опять же, мы мало можем сказать про качество данной программы, вроде с одной стороны она выглядит неплохо, с другой — полиграфы и нейромаркетинг сильно настораживают. Если кто не в курсе — мы несколько скептично к нейромаркетингу, нейробизнесу, нейрообучению, и всяким другим вещам с приставкой нейро, имеющим относительно мало отношения собственно к нейронауке.

Информация из МГГУ:
«Магистратура открыта на факультете естественных наук, при активном участии базовой кафедры когнитивной нейробиологии Института высшей нервной деятельности РАН в МГГУ им. М.А. Шолохова. У нашей магистратуры есть собственная научно-исследовательская база — Институт нейронаук и когнитивных исследований (ИНКИ) МГГУ им. М.А. Шолохова, официальный сайт института: mggu-sh.ru/incs/
В этом году будет осуществляться набор на пятнадцать бюджетных и пять внебюджетных мест, очное образование. Особо приветствуются биологи, медики, психологи, прикладные математики и программисты. Не менее особо приветствуются филологи, педагоги, дизайнеры, пиарщики и прочая. Срок обучения два года, аудиторная нагрузка небольшая, обучение возможно совмещать с работой, наши текущие магистры успешно этим занимаются. Еще раз подчеркну: если вы хотите заниматься нейробиологией, психофизиологией или когнитивными исследованиями, но у вас нет профильного биологического или медицинского образования, не бойтесь поступать! Профильным биологическим дисциплинам и физиологии ВНД мы вас научим, а ваши знания по математике, программированию, лингвистике и даже дизайну очень пригодятся: сейчас у нас успешно учатся и выполняют реальные исследовательские работы два дизайнера и несколько математиков».

Подробности тут: ru-neuroscience.livejournal.com/99 568.html?view=624 624#t624624

Школа по анализу ЭЭГ данных в Москве, 20−25 июля 2015

#горячиеюныекогнитивные из Москвы, а также все, кто до этой самой Москвы готов доехать! Уже на следующей неделе, 20−25 июля в ПИ РАО пройде школа по современным методам анализа ЭЭГ данных с крутыми лекторами и интересными темами. Информационное письмо прикреплено к посту. Вкратце — вас ждут пять полных дней лекций и практикумов по различным аспектам анализа ЭЭГ, включая методв вызванных потенциалов, спектральный анализ, метод независимых компонент и работу с базами ЭЭГ-данных. Короче — круто!

Информационное письмо: tcts.cogitoergo.ru/wp-content/uploads/2015/07/EEG-Seminar_Moscow-2015.pdf

Число мест ограничено, чтобы принять участие пишите Илье Захарову ().

Mind and Brain Travel Awards

School of Mind and Brain в Берлине принимает заявки на travel-гранты для всех интересующихся поступлением в аспирантуру в 2016 году.

Грант покрывает расходы, связанные с проездом и проживанием в Берлине в течение 4 дней. Потенциальные аспиранты смогут познакомиться со студентами и преподавателями Школы, лабораториями и Берлином в целом. Особенно программа заинтересована в заявках по темам «Внимание и сознание».

Срок подачи заявок -- 15 августа.

Подробнее о грантах: www.mind-and-brain.de/news/detail/travel-awards-2015/a518213f1392d37314e3e5151e07aefa/
Подробнее об аспирантуре: www.mind-and-brain.de/doctoral-program/

цикл лекций по теме «Картирование речи во время нейрохирургических операций»

Лаборатория нейролингвистики Национального Исследовательского Университета Высшая Школа Экономики приглашает посетить цикл лекций по теме «Картирование речи во время нейрохирургических операций», которые пройдут 6−8 июля с 16 до 18 часов в Лаборатории нейролингвистики. Целью мероприятия является обмен опытом, знаниями и научными идеями между российскими и зарубежными учёными. Тематика лекций ориентирована на специалистов в области нейронаук, медицины, лингвистики, психологии, а также всех, кого интересуют вопросы мозговой патологии и нейро-аспекты языковой обработки.

Язык лекций — английский.

Расписание лекций и лекторы:
6 июля
16.00 — 18.00
Операции с пробуждением: точка зрения нейролингвиста
Петер Мариен, Факультет Клинической и Экспериментальной Нейролингвистики, Брюссельский Свободный Университет, Бельгия

7 июля
16.00 — 18.00
Современные тесты для картирования речи во время нейрохирургических операций
Рулин Бастиаансе, Факультет Нейролингвистики, Университет Гронингена, Нидерланды
Эви Брин, Факультет Неврологии и Нейрохирургии, Медицинский Центр Эразмус, Роттердам, Нидерланды

8 июля
16.00 — 18.00
Организация внутриоперационного тестирования речи в Нидерландах, Бельгии и России (Джайна Сатур, Элке де Витте, Анна Крабис)
Джайна Сатур, Факультет Неврологии и Нейрохирургии, Медицинский Центр Эразмус, Роттердам, Нидерланды
Элке де Витте, Факультет Клинической и Экспериментальной Нейролингвистики, Брюссельский Свободный Университет, Бельгия
Анна Крабис, Лаборатория Нейролингвистики, Высшая Школа Экономики, Москва, Россия

Мероприятие пройдет в лаборатории нейролингвистики НИУ ВШЭ по адресу: ул. Старая Басманная, д. 21/4, строение 1, аудитория 510.
Пожалуйста, зарегистрируйтесь на лекции: docs.google.com/forms/d/1u11RiW9PR357t30YvpV0bGTcbqFypRnHg0kvfWIxRYU/viewform?usp=send_form
Если вам нужен пропуск в корпус НИУ ВШЭ, не забудьте взять с собой паспорт.