Первая статья проекта MyConnectome

Прошлая неделя выдалась продуктивной для исследователей коннектома человека. Во-первых, в Neuron вышла удивительная статья от группы Рассела Полдрака по результатам проекта MyConnectome (http://myconnectome.org/).
На протяжении 76 недель (!), три раза в неделю (!) сам Рассел Полдрак проводил время в сканере, собирая данные о своем мозге (фМРТ с классическими задачами и в состоянии покоя). В результате в распоряжении исследователей оказалось огромное количество данных об одном-единственном мозге. С помощью этих бесценных данных стало возможным в том числе проанализировать, насколько парцелляция на основе состояния покоя соответствует активациям, полученным у того же испытуемого при выполнении задаы, а также проверить, насколько стабильны результаты от сессии к сессии у одного и того же испытуемого. Подробнее об исследовании можно прочесть в статье, или посмотреть в замечательном видео-абстракте, но основные результаты показали, что в целом возможно восстановить стабильную и подробную картину функциональной структуры индивидуального мозга, и эта картина в чем-то будет отличаться от групповой (почему -- отдельный вопрос), но для составления такого «портрета» необходимо гораздо больше данных, чем принято записывать в классических фМРТ-парадигмах. Кроме того, отмечено, что источники изменчивости в данных различаются при внутрииндивидуальном и межиндивидуальном анализе.

Ссылка на статью (и видео-абстракт!): T. Laumann et al. (2015) Functional System and Areal Organization of a Highly Sampled Individual Human Brain.
http://www.cell.com/neuron/abstract/S0896−6273(15)00600−5

И десерт. Вышел совершенно чудесный тулбокс для анализа связей мозга (connectivity). Он называется Multimodal Imaging Brain Connectivity Analysis toolbox (MIBCA) и позволяет проводить анализ мультимодальных данных в одной среде от начала и до конца, что раньше было практически невозможно. Тулбокс и подробности можно найти здесь: www.mibca.com/, а статью с описанием методов -- здесь: peerj.com/articles/1078/

Приятных вам связей, #горячиеюныекогнитивные!


Ортогонализация регрессоров в данных фМРТ

В Plos ONE вышла статья, очень понятно объясняющая принципы и правила ортогонализации регрессоров для фМРТ.

Статья будет полезна для прочтения всем, кто проводит или планирует фМРТ-исследования, особенно тем, кто пользуется программой SPM. Процедура ортогонализации часто используется без понимания ее влияния на интерпретацию результатов, а в некоторых случаях вообще применяется автоматически, что приводит к ошибкам в трактовке данных. В статье рассказывается о том, как в фМРТ появляется коллинеарность моделей, когда эта коллинеарность опасна, как работает ортогонализация и как проводить ее в SPM и FSL. Must read.

journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.126 255

В качестве бонуса — видео человека, поющего «If I Only Had a Brain», сделанное при помощи новейшей техники скоростной томографии.


Журнальный клуб TCTS -- февраль

Сегодня в 20:00 по московскому времени состоится очередная встреча Журнального Клуба TCTS.

Будем обсуждать статью «Understanding the behavioural consequences of noninvasive brain stimulation» (Bestman, Berker, Bonaiuto, TiCS 2015). В онлайн-встрече есть еще несколько мест, поэтому если кто-то хочет в срочном порядке присоединиться -- напишите на . То же самое касается желающих получать объявления о Журнальном Клубе на постоянной основе. Всем продуктивного воскресенья!


Special Issue: Neurodevelopment

Вышел спецвыпуск журнала Developmental Cell по развитию нервной системы.

Среди интересных когнитивистами -- статьи о миелинации ЦНС, раннем нейрогенезе, генетических аспектах формирования мозга человека, и эволюции системы локомоции. Пока доступ открытый!

www.cell.com/developmental-cell/issue?pii=S1534−5807%2814%29X0029−8


Применение теории обнаружения сигнала к метакогнициям

Ну, а теперь — немного о серьезном.

Многие из тех, кто занимался экспериментами в когнитивной психологии, сталкивались с вопросами измерения «метакогниций», в основном в виде измерения уверенности. Интуитивно понятно и научно подтверждено, что уверенный ответ чаще является правильным. Изменения в степени связи между уверенностью и правильностью ответов рассматриваются как один из показателей неосознаваемой обработки информации. Классически, для измерения этой связи используются коэффициенты корреляции.

В своей новой статье в Frontiers in Human Neuroscience Стив Флеминга и Хакван Лау критикуют этот подход, отмечая, что подобный способ измерения подвержен нежелательным влияниям из-за систематических отклонений в ответах (response biases). В психофизических исследований с подобными отклонениями уже давно научились справляться при помощи методов, основанных на теории измерения сигнала (SDT). Флеминг и Лау предложили подобный подход применить и в исследованиях метакогниций (стоит отметить, что эта идея разрабатывалась уже достаточно давно, но статья во Frontiers обобщает наработки). Применение методов SDT к метакогнициям не только улучшает точность измерения, но и дает возможность выделить компоненты уверенности, такие как собственно метакогнитивная ошибка (стабильное субъективное недооценивание или переоценивание собственной результативности), метакогнитивная чувствительность (насколько человек способен отличить собственный неправильный ответ от правильного) и эффективность метакогниции (насколько уверенность реально отражает результативность у конкретного человека). Измерение этих компонентов позволяет с гораздо большей точностью обнаруживать метакогнитивные сдвиги при решении различных задач, и открывает богатые просторы для анализа и моделирования метакогниций.

Всем, кто занимается или планирует заниматься анализом уверенности — TCTS рекомендует.

Препринт — http://journal.frontiersin.org/Journal/10.3389/fnhum.2014.443/abstract

pic: xkcd


«The Meaning of „Significance“ for Different Types of Research»

В Acta Psychologica опубликован перевод на английский статьи классика голландской психологии Адриана де Гроота «The Meaning of „Significance“ for Different Types of Research».

Несмотря на то, что статья была написана в 1956 году, к 2014 она стала лишь актуальнее — в ней рассматривается острый для современной психологии вопрос различия «эксплораторного» и «конфирматорного» типов исследования и соответствующих аналитических практик.

Текст, несмотря на тему, читается очень легко, а в комментариях переводчики анализируют идеи автора в современном контексте.

#TCTS весьма рекомендует к прочтению!

Препринт статьи в открытом доступе: http://www.ejwagenmakers.com/inpress/DeGroot1956_TA.pdf

pic: http://pps.sagepub.com/content/7/6/632/F1.large.jpg

Original: http://pps.sagepub.com/content/7/6/632/F1.large.jpg


Выпуск философского журнала «Логос» о когнитивной науке

Вышел новый выпуск философского журнала «Логос», посвященный когнитивной науке.

Ссылка на выпуск: http://logosjournal.ru/cgi-bin/arch.pl?action=show&id=73&lang=ru. Там собрано несколько обзорных статей про когнитивную науку вообще. Плюс перевод статьи Альва Ноэ про «великую иллюзию сознания» (в честь которой называны и когнитивные семинары «Великая иллюзия», проходящие раз в год в Москве и Питере: http://cogitoergo.ru/event/velikaya-illyuziya-soznaniya-2013/#.VAmgXmuWzIU, http://chetvericov.ru/event/velikaya-illyuziya-2-soznanie-i-kognitivnoe-bessoznatelnoe/). Если вы все еще не до конца понимаете, что такое когнитивная наука (откроем тайну — вы не одиноки), возможно, этот выпуск натолкнет вас на некоторые идеи. Ну и вообще, интересно почитать исторические обзоры. Читать далее Выпуск философского журнала «Логос» о когнитивной науке