TCTS weekly: от летних школ по нейронауке до таинственных препринтов

Коллеги, мы рады представить вам вторую подборку полезных материалов из чата!
Присоединяйтесь к рассылке (http://tinyletter.com/TCTSweekly) и предлагайте новости в чате (https://telegram.me/thinkcog).

Приятного чтения!

КУДА ПОЕХАТЬ

ЧТО ПОЧИТАТЬ


TCTS weekly: от анализа данных до сегментирования гиппокампа

Коллеги, с сегодняшнего дня мы начинаем публиковать для вас еженедельные подборки полезных материалов из telegram-чата.
Приятного чтения!

КУДА СХОДИТЬ

  • Круглый стол «Сломана ли наука?..», 11 апреля. В программе: обсуждение причин репликационного кризиса в психологии и освещение вариантов решения проблемы. Специально для #горячихюныхкогнитивных регистрация закрывается позже, сегодня в 22:00. https://vk.com/scienceisntbroken

ЧТО ПОЧИТАТЬ

ЧТО ПОСМОТРЕТЬ

ЧЕМУ НАУЧИТЬСЯ

Желаем продуктивной недели!


Jane: оценка названий журналов и авторов

Случалось ли вам задумываться над тем, в какой журнал отправить статью? Интересоваться ключевыми авторами в какой-либо теме? Оказывается, помимо анализа обзорных статей и Google Scholar’а для этого можно воспользоваться интересным инструментом от голландских исследователей биосемантики — Journal/Author Name Estimator, или просто Jane.
Jane использует в качестве входной информации абстракт, название статьи или просто ключевые слова, сравнивает их с текстами Medline и возвращает список наиболее похожих статей, авторов, или журналов. Подробнее алгоритм описан здесь: goo.gl/9THDvi. В качестве бонуса Jane умеет маркировать журналы с открытым доступом и сравнивать журналы по вероятности цитирования.

Ссылка на Jane: http://www.biosemantics.org/jane/index.php


Спецвыпуск Phil Trans B о регуляции мозговой активности

Журнал Philosophical Transactions выпустил тематический номер с красивым названием «Регуляция активности мозга для изменения восприятия, поведения и общества».

Выпуск в основном состоит из обзоров, показывающих возможности, достижения и проблемы различных техник нейростимуляции и контроля мозговой активности. Обсуждаются как клинические, так и фундаментальные исследования, на разных уровнях (клетки, ансамбли и т. д.) и в разных организмах. Получился отличный срез современного состояния темы, must read для тех, кто интересуется возможностями и будущим нейрорегуляции. Часть статей находится в открытом доступе.

Читать на сайте журнала: rstb.royalsocietypublishing.org/content/370/1677


Ортогонализация регрессоров в данных фМРТ

В Plos ONE вышла статья, очень понятно объясняющая принципы и правила ортогонализации регрессоров для фМРТ.

Статья будет полезна для прочтения всем, кто проводит или планирует фМРТ-исследования, особенно тем, кто пользуется программой SPM. Процедура ортогонализации часто используется без понимания ее влияния на интерпретацию результатов, а в некоторых случаях вообще применяется автоматически, что приводит к ошибкам в трактовке данных. В статье рассказывается о том, как в фМРТ появляется коллинеарность моделей, когда эта коллинеарность опасна, как работает ортогонализация и как проводить ее в SPM и FSL. Must read.

journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.126 255

В качестве бонуса — видео человека, поющего «If I Only Had a Brain», сделанное при помощи новейшей техники скоростной томографии.


Google Scholar button

Новый удобный инструмент от Google -- Google Scholar Button для Chrome.

Позволяет искать статьи одним нажатием кнопки. Поисковый запрос вводится либо вручную, либо просто выделением текста в браузере.

Способ применения #1.

1. Найти интересную ссылку, читая что-то в браузере.

2. Выделить название/авторов/whatever.

3. Нажать на Scholar-кнопку.

4. Перейти сразу к тексту статьи.

Screen Shot 2015-04-09 at 10.30.07

Способ применения #2.

1. Захотеть полную ссылку на некую статью.

2. Полениться открывать reference manager.

3. Нажать на Scholar-кнопку, ввести запрос в поисковую строку.

4. Нажать на значок кавычки -- получить ссылку в APA-формате.

Screen Shot 2015-04-09 at 10.41.31

Вот так просто. Никаких ctrl+c ctrl+v и переходов на сайт Google Scholar -- все под рукой.


Royal Society об истории науки

В честь 350-летия первого в мире научного журнала -- Philosophical Transactions -- британская Академия Наук (The Royal Society) на месяц открыла доступ к полному архиву издания.

Для многих из нас это уникальная и очень вдохновляющая возможность прикоснуться к истории науки -- в архиве есть ранние исследования по анатомии и физиологии мозга и сенсорных систем, статьи Дарвина, а также первое описание теории Байеса. Кроме того, Royal Society записали интервью с современными учеными, которые рассказывают о своей работе и о ее связи с открытиями, сделанными в предыдущих столетиях. Одно из интереснейших интервью — с нейроучеными Карлом Фристоном и Франческой Хаппе.

Ссылка на архив: rstl.royalsocietypublishing.org/content/by/year


Журнальный клуб TCTS -- февраль

Сегодня в 20:00 по московскому времени состоится очередная встреча Журнального Клуба TCTS.

Будем обсуждать статью «Understanding the behavioural consequences of noninvasive brain stimulation» (Bestman, Berker, Bonaiuto, TiCS 2015). В онлайн-встрече есть еще несколько мест, поэтому если кто-то хочет в срочном порядке присоединиться -- напишите на . То же самое касается желающих получать объявления о Журнальном Клубе на постоянной основе. Всем продуктивного воскресенья!


Зеркальные нейроны

В Сurrent Biology вышел замечательный короткий обзор по зеркальным нейронам (открытый доступ!).

В центре внимания -- отделение экспериментально подтвержденных фактов от мифов и спекуляций. Отдельно стоит отметить несложную математику: всего по ключевым словам «mirror neuron (s)» в PubMed зарегистирировано более 800 статей. Из них действительно точно о зеркальных нейронах (т.е. электрофизиологические исследования) -- 25. Большая же часть статей -- это исследования людей, в основном с помощью фМРТ. И здесь важно помнить, что наличие у людей зеркальных нейронов еще нужно доказать.

Несмотря на то, что вроде бы зоны активации, полученные в фМРТ исследованиях мозга людей, пересекаются с аналогичными зонами, в которых были найдены зеркальные нейроны у макак, нельзя забывать, что фМРТ показывает результаты на уровне популяции, а электрофизиология -- на уровне клетки. Вполне возможно, что статистически значимая активация популяции включает в себя нейроны, сами по себе значимо не модулирующие. Кроме того, не стоит забывать, что в в большей части фМРТ-исследований не проводится контроль с самостоятельным движением (совершается только наблюдение за действием, но не его исполнение), что также может привносить активацию не-зеркальных нейронов в полученные результаты.

Одна из устоявшихся техник для выделения в фМРТ отдельных нейронных популяций -- парадигма подавления повторения (repetition suppression). Мы знаем, что при повторном предъявлении стимула с определенной характеристикой интенсивность нейронного ответа (и -- скорее всего -- BOLD-ответа) снижается. Следовательно, если в коре есть популяции, снижающие BOLD-ответ как при наблюдении за действием с последующим его исполнением, так и при исполнении его с последующим наблюдением, это будут популяции зеркальных нейронов. Таких исследований существует 5, из них лишь 3 с положительным результатом. Правда, есть вероятность, что зеркальные нейроны не проявляют адаптации к повторению, но это еще тоже нужно исследовать.

Мораль проста: можно очень красиво разговаривать о том, что зеркальные нейроны способствовали развитию нашей культуры и вообще являются источником всего человеческого. Но нужно помнить, что найдены они в у обезьян, а в мозге человека мы только пытаемся их найти и разгадать.

Статья в Current Biology -- www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982213013262


Special Issue: Neurodevelopment

Вышел спецвыпуск журнала Developmental Cell по развитию нервной системы.

Среди интересных когнитивистами -- статьи о миелинации ЦНС, раннем нейрогенезе, генетических аспектах формирования мозга человека, и эволюции системы локомоции. Пока доступ открытый!

www.cell.com/developmental-cell/issue?pii=S1534−5807%2814%29X0029−8